Secuenciación del genoma completo de genomas bacterianos: herramientas y aplicaciones - Curso Virtual - Coursera Verified listing

Este curso cubrirá el tema de la secuenciación del genoma completo (WGS) de genomas bacterianos, que se está volviendo cada vez más relevante para el sector médico.

La tecnología y las aplicaciones WGS ocupan un lugar destacado en la agenda política internacional, ya que los métodos clásicos están siendo reemplazados por la tecnología WGS y, por lo tanto, las herramientas bioinformáticas son extremadamente importantes para permitir que las personas que trabajan en este sector puedan analizar los datos y obtener resultados que puedan interpretarse.

y se utiliza para diferentes propósitos.

El curso brindará a los alumnos una base para comprender y familiarizarse con las aplicaciones WGS en la vigilancia de bacterias, incluida la identificación de especies, la tipificación y la caracterización de la resistencia antimicrobiana y los rasgos de virulencia, así como la caracterización de plásmidos.

También brindará a los alumnos la oportunidad de aprender sobre las herramientas en línea y para qué se pueden usar a través de demostraciones sobre cómo usar algunas de estas herramientas y ejercicios para que los alumnos los resuelvan con el uso de herramientas de análisis WGS disponibles gratuitamente.

Al final de este curso, debería poder: 1.

Describir los principios generales en la tipificación de bacterias 2.

Dar ejemplos de las aplicaciones de la secuenciación del genoma completo para la vigilancia de patógenos bacterianos y resistencia a los antimicrobianos 3.

Aplicar herramientas genómicas para la subtipificación y vigilancia 4.

Definir el concepto de secuenciación de próxima generación y describir los datos de secuenciación de NGS 5.

Describir cómo hacer un ensamblaje de novo desde lecturas sin procesar hasta contigs 6.

Enumerar los métodos detrás de las herramientas para la identificación de especies, tipificación MLST y genes de resistencia detección 7.

Aplicar las herramientas de identificación de especies, tipificación MLST y detección de genes de resistencia en casos reales de otros genomas bacterianos y patógenos.

8.

Describir los métodos detrás de las herramientas para tipificación de Salmonella y E.

coli, detección de replicón de plásmido y tipificación de plásmido 9.

Utilizar las herramientas para tipificación de Salmonella y E.

coli, detección de replicón de plásmido y tipificación de plásmido en casos reales de otros genomas bacterianos y patógenos .

10.

Explicar el concepto y ser capaz de utilizar la canalización de análisis bacteriano integrado para el análisis por lotes y la tipificación de datos genómicos 11.

Demostrar cómo construir un árbol filogenético basado en SNP 12.

Aplicar la herramienta filogenética para construir árboles filogenéticos y explicar la relación de bacterias o cepas patógenas 13.

Describa cómo crear su propia base de datos de secuencias 14.